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鸡星状病毒和禽肾炎病毒二重荧光RT-LAMP检测方法的建立

发布时间:2025-02-28 15:47:12

赵俊柯1,2余丹1,2尹文巧1,2张艳芳2谢志勤2范晴2喻华英1,2谢芝勋2

1.广西大学动物科学技术学院2.广西壮族自治区兽医研究所农业农村部中国(广西)-东盟跨境动物疫病防控重点实验室/广西兽医生物技术重点实验室

摘要:为建立一种能鉴别鸡星状病毒(chicken astrovirus, CAstV)和禽肾炎病毒(avian nephritis virus, ANV)的二重荧光RT-LAMP,该研究对比GenBank中下载的CAstV ORF1b基因和ANV ORF1b基因保守序列,分别设计了2套特异性引物和标记荧光基团的探针。在CAstV探针3′端标记FAM荧光基团,5′端标记淬灭基团BHQ1;ANV探针3′端标记CY3荧光基团,5′端标记淬灭基团BHQ2,通过试验筛选出最适引物和探针浓度并进行反应条件的优化。用建立的二重荧光RT-LAMP进行特异性、敏感性、重复性和干扰性试验,并对采集自广西南宁不同地区的临床样品共300份进行检测,结果与RT-qPCR和RT-PCR比较,验证该方法的有效性。试验结果显示:建立的二重荧光RT-LAMP方法60 min即可反应结束,最适反应温度为65℃;设计的引物仅能检测CAstV和ANV,而对其他病源无交叉反应;CAstV最低检测限度为1.4×10~2 copies/μL,ANV最低检测限度为1.5×10~2 copies/μL,且干扰性试验和重复性试验良好;检测结果

与RT-qPCR相比,CAstV和ANV检测结果符合率分别为97.97%和98.85%。综上所述,该研究建立的二重荧光RT-LAMP方法具有快速、准确、特异性好、灵敏性高、重复性好等特点,适用于临床诊断,为CAstV和ANV的流行病学调查提供技术支持。


关键词: 鸡星状病毒;禽肾炎病毒;可视化;RT-LAMP;鉴别诊断;

基金资助: 广西科技基地和人才专项资助项目(桂科AD17195083); 广西兽医生物技术重点实验室自主研究基金资助项目(24-035-32-A-01); 桂农科盟基金资助项目(202409-01); 广西八桂学者专项资助项目(2019A50);

DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2025.02.05

专辑: 农业科技;基础科学

专题: 生物学;畜牧与动物医学

分类号: S852.65

在线公开时间: 2025-02-28